Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hivep3A2A884 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hivep3A2A884 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hivep3A2A884 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hivep3A2A884 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hivep3A2A884 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hivep3A2A884 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hivep3A2A884 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hivep3A2A884 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms