Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc173A0JLY1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms