Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2P7S8

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2P7S8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2P7S8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2P7S8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms