Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trav4-2A0A075B638 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trav4-2A0A075B638 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav4-2A0A075B638 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trav4-2A0A075B638 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav4-2A0A075B638 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trav4-2A0A075B638 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trav4-2A0A075B638 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trav4-2A0A075B638 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trav4-2A0A075B638 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trav4-2A0A075B638 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trav4-2A0A075B638 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trav4-2A0A075B638 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trav4-2A0A075B638 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav4-2A0A075B638 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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