Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5M9

Igkv18-36, Immunoglobulin kappa chain variable 18-36, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv18-36A0A075B5M9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv18-36A0A075B5M9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Igkv18-36A0A075B5M9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms