Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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