Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms