Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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