Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne6Q9Z140 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne6Q9Z140 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms