Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax2Q9WTP9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vax2Q9WTP9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms