Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms