Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ripk3Q9QZL0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ripk3Q9QZL0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ripk3Q9QZL0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms