Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms