Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms