Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms