Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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