Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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