Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l2Q9JLG4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms