Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CubnQ9JLB4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms