Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms