Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms