Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Snx5Q9D8U8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx5Q9D8U8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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