Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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