Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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