Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc105Q9D4K7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms