Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms