Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spns3Q9D232 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms