Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms