Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Arv1Q9D0U9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Arv1Q9D0U9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms