Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zbed3Q9D0L1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbed3Q9D0L1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbed3Q9D0L1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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