Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab3bQ9CZT8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab3bQ9CZT8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms