Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms