Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SdhdQ9CXV1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SdhdQ9CXV1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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