Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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