Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms