Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm8aQ9CWZ3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms