Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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