Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms