Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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