Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms