Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms