Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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