Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf144aQ925F3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf144aQ925F3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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