Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin3bQ91ZU9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin3bQ91ZU9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms