Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms