Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Snx11Q91WL6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Snx11Q91WL6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Snx11Q91WL6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Snx11Q91WL6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Snx11Q91WL6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Snx11Q91WL6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms