Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms