Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col26a1Q91VF6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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