Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms