Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ubxn4Q8VCH8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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